Хроматин (от греч.(греческий) chroma, родительный падеж chromatos — цвет, краска), вещество хромосом, находящееся в ядрах растительных и животных клеток; интенсивно окрашивается ядерными красителями; во время деления клетки формируется в определённые видимые структуры в хромосомах. Термин введён в 1880 немецким гистологом В. Флеммингом. В современной цитологии под Х. чаще всего подразумевают хромосомное вещество ядра клетки в интерфазе (между последовательными её делениями), т.к. хромосомы в этот период клеточного цикла под микроскопом плохо обнаруживаются. В состав Х. в определённых пропорциях входят: дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) (30—40%), рибонуклеиновая кислота (РНК), гистоныи негистоновые белки. Основной структурный компонент Х. — дезоксирибонуклеопротеидные нити (ДНП) диаметром 100—200 , основу каждой из которых, по мнению большинства исследователей, составляет одна молекула ДНК(дезоксирибонуклеиновая кислота). Предложено две модели тонкой структуры элементарной нити Х.: суперспиральная (американские учёные Д. Пардон, М. Уилкинс, 1972) и глобулярная (американские учёные А. Корнберг, А. Л. Олинс и Д. Э. Олинс, 1974). Экспериментально более подтверждена глобулярная модель, предполагающая, что элементарная нить Х. — это гибкая цепь из повторяющихся субъединиц — нуклеосом, каждая из которых заключает в себе изогнутый участок ДНК(дезоксирибонуклеиновая кислота) размером 150—200 пар нуклеотидов и комплекс из 8 молекул гистонов.
Различают генетически активный Х. (эухроматин) и неактивный (гетерохроматин). В ядрах клеток особей женского пола многих организмов (в частности, млекопитающих животных и человека) обнаружены крупные плотные глыбки Х., которых нет у особей мужского пола. Такой Х. назван «половым Х.». Образуется он, по-видимому, неактивными участками половых хромосом (в основном гетерохроматином одной из парных Х-хромосом).