Механізм гідролізу полісахариду лізоцимом. Показані 3 з 6 кілець, що поміщаються в щілини ферменту. Глікозідная зв'язок між кільцями 4 і 5 активується взаємодією між залишками аспарагінової (А) і глутамінової (Г) кислот головного ланцюга лнзоцима і атомами вуглецю кільця 4 і кисню, що зв'язує кільця 4 і 5. Після розриву зв'язку дві частини молекули субстрата звільняються, і фермент отримує можливість розщеплювати наступну ділянку полісахарідной ланцюга.