Рентгенографія молекул , область рентгенівського структурного аналізу, присвячена вивченню будови молекул, що знаходяться в станах, що конденсують (кристали, аморфні речовини і молекулярні рідини). При дослідженні молекул газів і пари отримують їх рентгенограми, на яких спостерігаються одне або декілька розмитих дифузних кілець; такі рентгенограми дозволяють у ряді випадків визначати міжатомні відстані в молекулі.