Нітріфікация (від нітр... і лат.(латинський) facio — роблю), процес мікробіологічного перетворення амонійних солей в нітрати — основну форму азотного живлення рослин. Протікає в грунті і воді водоймищ. Н. завершує мінералізацію органічних сполук азоту, почату амоніфікацією, і є показником родючості грунту. Викликається хемосинтезуючими нітрифікуючими бактеріями . Протікає в 2 стадії. Спочатку іон амонія окислюється бактеріями першої стадії Н. у нітрит-іон, а потім нітрит-іон окислюється бактеріями другої стадії Н. у нітрат-іон. Н. йде при рН грунти 5—9. Нітрифікатори — аеробні організми, і при недоліку в грунті повітря Н. припиняється. Хороша обробка грунту, покращуючи її аерацію, підсилює Н.
В результаті збільшеного спалювання палива (заводи, двигуни внутрішнього згорання) в атмосфері утворюються оксиди азоту, які потрапляють в грунт і воду водоймищ з дощем у великій кількості і перетворюються там за допомогою нітрифікуючих бактерій в нітрати. Надмірне збагачення ними води робить її непридатними для пиття. Щоб попередити посилене утворення нітратів у воді, інколи застосовують хімічні препарати, гальмівні Н. у грунті.