Ендоміксис (від ендо... і греч.(грецький) míxis — змішення), періодична перебудова ядерного апарату в деяких інфузорій. Відкритий в 1914 в Paramecium aurelia американськими ученими Л. Вудреффом і Р. Ердман, які описали при Е. руйнування макронуклеуса і двократне ділення мікронуклеуса; частина продуктів ділення без злиття (запліднення) перетворюється на макронуклеуси частина в мікронуклеуси, останні гинуть. Пізніше було показано, що у такому вигляді перебудови ядра в інфузорій не буває — диференціюванню макро- і мікронуклеусов передує злиття ядер (за типом самозапліднення, або автогамії ) . Отже, Е. — одна з форм статевого процесу.