Биоиндикаторы, биологические индикаторы, организмы, присутствие, количество или интенсивность развития которых служит показателем каких-либо естественных процессов или условий среды обитания, например присутствия или отсутствия некоторых веществ (в т. ч. практически важных).
Скопления морских рыбоядных птиц служат Б. местонахождения косяков рыбы. По составу планктона можно судить о вероятности успешного промысла сельди и некоторых других рыб, обитающих в толще воды. Наличие многих донных и планктонных организмов указывает на происхождение водных масс, например атлантических вод в Полярном бассейне; состав диатомовых водорослей плавучих льдов — на происхождение и пути дрейфа этих льдов. Обилие диатомовых водорослей (Cocconeis ceticola) на коже китов служит показателем продолжительности пребывания их в водах Антарктики. Б. широко применяются для санитарной оценки вод. По составу флоры и фауны вод можно судить об их пригодности для питьевого водоснабжения и об эффективности работы очистных сооружений. Существуют различные системы биологического анализа степени загрязнённости (сапробности) вод по организмам Б.
Ориентировочная оценка качества почвы может быть осуществлена с помощью т. н. индикаторных растений. В СССР биологическая индикация почв, основанная на различиях почвенной фауны, предложена М. С. Гиляровым (1949) и на микробиологических показателях — Е. Н. Мишустиным (1950). При поисковых работах геологи используют индикаторные растения. По наличию в поверхностных слоях земной коры некоторых групп микроорганизмов можно составить ориентировочное представление о наличии в недрах горючих газов и нефти (В. С. Буткевич и др.).
При космических исследованиях животные, растения и микроорганизмы используются как Б. для выяснения воздействия факторов космического пространства на организмы.
Широкое применение нашли микроорганизмы как Б. в аналитических работах (определение витаминов, антибиотиков, аминокислот и других веществ).