Чистая линия, генотипически однородное потомство постоянно самоопыляющихся растений или самооплодотворяющихся животных, большая часть генов которого находится в гомозиготном состоянии. Термин введён в 1903 датским генетиком В. Иогансеном, который в опытах на бобовых растениях доказал, что в Ч. л. при одинаковых условиях проявляется сходный фенотип. Ч. л. получают от одного предка и поддерживают с помощью принудительного самоопыления и отбора. Особи в Ч. л. воспроизводят в ряду поколений одни и те же наследственно закрепленные признаки. Ч. л. имеют важное значение в с.-х.(сельскохозяйственный) производстве, являясь основными структурными элементами сортов растений. Гибридизация двух Ч. л. в ряде случаев приводит к эффекту гетерозисав первом гибридном поколении (так получают некоторые гибридные формы кукурузы). Иногда термин Ч. л. неправильно применяют к т. н. инбредным линиям, которые представляют собой потомство животных или растений (перекрёстноопыляющихся), получаемое от одной пары предков и поддерживаемое в ряду поколений с помощью постоянных близкородственных скрещиваний и отбора. Такие линии используют в подавляющем большинстве генетических исследований на высших организмах. Например, механизмы канцерогенеза и методы лечения раковых заболеваний изучаются на т. н. «Ч. л.» лабораторных мышей.